Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMPD3Q9NY59 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms