Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D2Q9NY47 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms