Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDAP2Q9NXN4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GDAP2Q9NXN4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms