Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPD4Q9NXE4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms