Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD8Q9NX08 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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