Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCAF13Q9NV06 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms