Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZCCHC3Q9NUD5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC3Q9NUD5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms