Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCC13Q9NSE7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC13Q9NSE7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms