Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms