Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPORSQ9NS56 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPORSQ9NS56 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms