Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMCO4Q9NRQ5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms