Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C8orf17Q9NRJ1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
C8orf17Q9NRJ1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms