Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms