Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FBXO6Q9NRD1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO6Q9NRD1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms