Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR21

PARP11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP11Q9NR21 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PARP11Q9NR21 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PARP11Q9NR21 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms