Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4BQ9NPR2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms