Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A4GALTQ9NPC4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms