Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPCPD1Q9NPB8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms