Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL47Q9HD33 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms