Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOPCQ9HD26 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOPCQ9HD26 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms