Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMURF1Q9HCE7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMURF1Q9HCE7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms