Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELL3Q9HB65 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELL3Q9HB65 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELL3Q9HB65 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms