Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP110Q9HB58 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP110Q9HB58 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms