Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCAS3Q9H6U6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAS3Q9H6U6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms