Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNDC4Q9H6D8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNDC4Q9H6D8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms