Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RABEP2Q9H5N1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABEP2Q9H5N1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms