Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNMDQ9H2S6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNMDQ9H2S6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms