Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms