Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP2Q9H175 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP2Q9H175 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP2Q9H175 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms