Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A4Q9H015 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC22A4Q9H015 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms