Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NYXQ9GZU5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms