Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM39BQ9GZU3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39BQ9GZU3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms