Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFDQ9GZP0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms