Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC27Q9C0I9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms