Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
THSD7BQ9C0I4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7BQ9C0I4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7BQ9C0I4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7BQ9C0I4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7BQ9C0I4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD7BQ9C0I4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms