Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRCC1Q9C099 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRCC1Q9C099 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms