Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ROPN1BQ9BZX4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms