Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXP3Q9BZS1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXP3Q9BZS1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms