Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDEM3Q9BZQ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms