Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM3Q9BZL3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM3Q9BZL3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms