Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPF3BQ9BZI7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms