Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5DQ9BY66 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5DQ9BY66 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms