Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms