Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A5Q9BY07 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms