Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MAP1LC3CQ9BXW4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3CQ9BXW4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms