Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL3Q9BXA9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms