Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP85Q9BW27 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP85Q9BW27 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP85Q9BW27 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms