Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB1Q9BVT8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB1Q9BVT8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms