Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB6Q9BUF5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms