Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NDC1Q9BTX1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms